В: Программа сообщает о том, что невозможно найти файл d3dx9_NN.dll
где NN какое-то число.

О: Это говорит о том, что программа не смогла найти нужную версию DirectX, установите более новую версию DirectX.
Скачать ее можно тут

В: В игре используется термин "матрица" что это такое ?

О: Матрица - это своего рода шаблон корабля или города. Т.е. каждый корабль имеет набор слотов, в которые можно устанавливать орудия, защитные поля, двигатели и т.д. Так вот набор этих слотов в игре называется - корпус корабля. А вот комбинация орудий, защитныйх полей и других устройств - в игре называется матрица корабля. Т.е. исследовав корпус к примеру истребителя Вы можете на его базе сделать несколько матриц, отличающихся по компоновке орудий на ваш вкус. Так же и город, имеет свой шаблон и его наполнение (матрицу)